Diagnóstico laboratorial do SARS-CoV-2 por transcrição reversa seguida de reação em cadeia da polimerase em tempo real (RT-PCR) / Laboratory diagnosis of SARS-CoV-2 by real time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR)

O diagnóstico da COVID-19 está alicerçado na clínica do paciente, nos exames de imagem e no diagnóstico laboratorial. O exame de detecção do ácido nucleico viral por transcrição reversa (RT) seguido da reação em cadeia da polimerase em tempo real (PCR) foi rapidamente o primeiro método de diagnóstico laboratorial estabelecido e permanece como o padrão ouro. Esta narrativa descritiva é resultado de uma busca referenciada onde o ponto focal foi descrever o diagnóstico laboratorial do SARS-CoV-2 por RT-PCR. O diagnóstico laboratorial do SARS-CoV-2 por RT-PCR envolve as etapas de extração do RNA, transcrição reversa para obtenção do DNA complementar e a reação em cadeia da polimerase. A detecção da amplificação do material genético é realizada pela medida de fluorescência emitida. Entre as várias amostras biológicas que podem ser utilizadas, aquela que tem apresentado mais praticidade e precisão é a de swab da nasofaringe. A coleta da amostra deve ser, idealmente, realizada até sete dias a partir do início dos sintomas. Quando o SARS-CoV-2 é detectado na RT-PCR, o diagnóstico de COVID-19 é confirmado. No entanto, um único resultado de SARS-CoV-2 não detectado em paciente sintomático não exclui o diagnóstico. O exame não tem apresentado reações cruzadas com outros patógenos respiratórios. Contudo, o exame é caro e demorado, e pode resultar em falso negativo devido ao momento inadequado da coleta da amostra, coleta e manuseio impróprio de amostras e material genético viral insuficiente no sítio de coleta. Lacunas diagnósticas ainda permanecem na triagem de assintomáticos e na detecção de vírus vivos na convalescença.

The diagnosis of COVID-19 is based on the patient's clinic, imaging tests and laboratory diagnosis. The detection of viral nucleic acid by reverse transcription (RT) followed by real-time polymerase chain reaction (PCR) was quickly the first established laboratory diagnosis method and remains the gold standard. This descriptive narrative is a result of a referenced search where the focal point was to describe the laboratory diagnosis of SARS-CoV-2 by RT-PCR. The laboratory diagnosis of SARS-CoV-2 by RT-PCR involves the RNA extraction, reverse transcription to obtain complementary DNA, and the polymerase chain reaction steps. The detection of genetic material amplification is carried out by measuring the emitted fluorescence. Among the various biological samples that can be used, the one that has shown the most practicality and precision is the nasopharyngeal swab. Sample collection should be performed, ideally, within 7 days from the symptoms onset. When SARS-CoV-2 is detected by RTPCR, the diagnosis of COVID-19 is confirmed. However, a single result of undetected SARS-CoV-2 in a symptomatic patient does not exclude the diagnosis. The test has not shown cross-reactions with common respiratory pathogens. However, the test is costly and timeconsuming, a false-negative result may arise due to inadequate sample collection time, improper samples collection and handling, and insufficient viral genetic material at the collection site. Diagnostic gaps remain on asymptomatic patients screening, and in the detection of live viruses in convalescence.

Potential zoonotic parasites in dog and cat feces from three beaches and surrounding areas of Greater Florianópolis, Santa Catarina, Brazil / Potenciais parasitos zoonóticos em fezes de cães e gatos de três praias e seus arredores da Grande Florianópolis, Santa Catarina, Brasil

In Brazil, dogs and cats have free access in public areas in some cities, such as squares, parks and beaches, despite restrictive laws for their permanence in these places. Animals infected with intestinal parasites contaminate the environment through their feces. The present study aimed to verify the occurrence of helminth eggs, oocysts and protozoan cysts in stool samples from three beaches in Greater Florianópolis, Santa Catarina, Brazil, from March 2017 to April 2018. Stool samples were processed by the Willis-Mollay flotation technique and the Hoffman sedimentation technique. The percentage of 47.65% of positive samples for helminths or protozoa was found on the southern beaches of Florianópolis island, with an occurrence of 52.78% at Morro das Pedras Beach and 42.86% at Campeche Beach. At Pinheira beach, in Palhoça, 56.66% of the samples were contaminated with one or more zoonotic parasites. In this study, the most prevalent parasites on the three beaches analyzed were hookworms and Trichuris vulpis, followed by Giardia spp. and Cystoisospora spp. Samples containing To x o c a r a spp. eggs were collected at Pinheira beach. It is concluded that the contamination of the beaches in the present study constitutes a public health problem, considering the possibility of zoonoses transmission. The importance of implementing sanitary programs for the control of parasites in dogs and cats is emphasized, as well as awareness and education programs, in order to reduce environmental contamination in public places.(AU)

No Brasil, cães e gatos têm livre acesso em áreas públicas em algumas cidades, como praças, parques e praias, apesar de leis restritivas para sua permanência nestes locais. Animais infectados por parasitos intestinais contaminam o meio ambiente por meio de suas fezes. O presente estudo teve como objetivo verificar a ocorrência de ovos de helmintos, oocistos e cistos de protozoários em amostras de fezes de três praias da Grande Florianópolis, Santa Catarina, Brasil, no período de março de 2017 a abril de 2018. As amostras de fezes foram processadas pela técnica de flutuação de Willis-Mollay e pela técnica de sedimentação de Hoffman. O percentual de 47,65% de amostras positivas para helmintos ou protozoários foi encontrado nas praias do sul da ilha de Florianópolis, na praia do Morro das Pedras a ocorrência foi de 52,78% e na do Campeche 42,86%. Na praia da Pinheira, em Palhoça, 56,66% das amostras estavam contaminadas com um ou mais parasitos zoonóticos. Os parasitos de maior ocorrência nas três praias analisadas foram os ancilostomídeos e Trichuris vulpis, seguidos de Giardia spp. e Cystoisospora spp. Amostras contendo ovos de To x o c a r a spp. foram colhidas na praia da Pinheira. Conclui-se que a contaminação das praias do presente estudo constitui um problema de saúde pública, tendo em vista à possibilidade de transmissão de zoonoses. Deve ser ressaltada a importância da implantação de programas sanitários para o controle de parasitas de cães e gatos e programas de conscientização e educação, a fim de reduzir a contaminação ambiental em locais públicos.(AU)

Mammomonogamus laryngeus: a human case report in florianopolis, Santa Catarina, Brazil

Mammomonogamus laryngeus (sin.: Syngamus laryngeus) is a nematode which parasites the respiratory tract of some animals. It is occasionally seen in humans, who present symptoms similar to other diseases with respiratory manifestations, such as a chronic dry cough and chest pain, in addition to a "foreign body" sensation in the throat. It can be diagnosed through rhinolaryngoscopy or bronchoscopy examinations, but this often occurs only after spontaneous expectoration of the worms, a long period of symptomatology and the use of several types of medication. In this report, we describe a case of syngamosis in Florianópolis (Santa Catarina, Brazil). The patient consulted several health professionals during the course of the disease and was prescribed numerous drugs. Diagnosis was eventually reached after the spontaneous expectoration of a nematode couple

Contamination by parasites of zoonotic importance in fecal samples from Florianópolis Beaches, Santa Catarina State, Brazil / Contaminação por parasitas de importância zoonótica em amostras fecais nas praias de Florianópolis, SC, Brasil

Helminths and protozoa are examples of endoparasites that, during their biological cycles, can alternate between free-life stages and parasitic stages in the environment. Pets, such as dogs and cats, live together with men and play an important role in the society; however, these animals may carry a large number of parasites which, besides showing direct pathogenicity to the host, represent risks to the human health, as is the case of parasitic zoonoses. Public areas like parks, gardens, squares and beaches may offer risks to human users since these environments may contain feces deposited by parasitized dogs. The present study verified the occurrence of helminth eggs and/or protozoan cysts or oocysts in fecal samples collected from sand strips at the beaches Armação do Pântano do Sul, Campeche and Morro das Pedras, in the south of Florianópolis Island, Santa Catarina State (SC), during the summer period. Pet feces were collected in the 2016/2017 summer season, from December 2016 to February 2017. In the Laboratory of Animal Parasitology (CCA-UFSC), fecal samples were processed based on Willis-Mollay flotation technique and Hoffman sedimentation technique. Samples from all three analyzed beaches were positive for the presence of parasites and fecal material was found along the seashore, sites where people walk freely and barefoot. Of 104 fecal samples collected, 45 (43.27%) were positive for one or more parasites. The greatest prevalence was found in Campeche Beach, which had 72.22% positive samples. Ancylostomids were most prevalent, indicating that cutaneous larva migrans is likely to occur in humans. Other parasites such as Trichuris vulpis, Toxocara spp. and Giardia spp. were also detected in coproparasitological analyses. Based on the results, it was concluded that contamination of the beaches in Florianópolis Island, SC, constitutes a public health problem due to the possibility of zoonosis transmission. These results reinforce the importance of establishing health programs for parasite control and educational programs for elucidating the risks of transmission of these zoonoses to the population, as an attempt to reduce environmental contamination risks at beaches of seaside resorts.(AU)

Helmintos e protozoários são exemplos de endoparasitas que, durante seus ciclos biológicos, podem alternar fases de vida livre e de vida parasitária no ambiente. Animais de companhia, como cães e gatos, possuem convívio direto com o homem e desempenham importante papel na sociedade, porém estes animais podem possuir muitos parasitas próprios que, além da patogenicidade direta ao hospedeiro, representam riscos à saúde humana, no caso das zoonoses parasitárias. A utilização de áreas públicas como parques, jardins, praças e praias por estes animais, pode oferecer riscos aos seus frequentadores humanos, uma vez que pode ocorrer a deposição de fezes nesses ambientes por cães parasitados. O presente estudo investigou a ocorrência de ovos de helmintos e/ou cistos ou oocistos de protozoários em amostras de fezes coletadas nas faixas de areia das praias da Armação do Pântano do Sul, Campeche e Morro das Pedras, no sul da ilha de Florianópolis, Estado de Santa Cararina-SC, Brasil, durante o período de verão. As coletas de amostras de fezes de animais domésticos foram realizadas na temporada de verão 2016/2017, a partir de dezembro de 2016 até fevereiro de 2017. No Laboratório de Parasitologia Animal (CCA-UFSC), as amostras de fezes foram processadas pela técnica de flutuação de Willis-Mollay e pela técnica de sedimentação de Hoffman. Amostras colhidas nas três praias analisadas mostraram-se positivas para a presença de parasitos. Material fecal foi observado ao longo de toda orla, locais em que as pessoas caminham livremente e sem calçados. De um total de 104 amostras de fezes coletadas nas praias, 45 (43,27%) estavam positivas a um ou mais parasitas. A praia do Campeche foi a que apresentou maior prevalência, com 72,22% de amostras positivas. Os ancilostomídeos, responsáveis pela larva migrans cutânea em humanos, foram os mais prevalentes. Outros parasitas como Trichuris vulpis, Toxocara spp. e Giardia spp. também foram detectados nas análises coproparasitológicas. Com base nos resultados obtidos, concluímos que a contaminação das praias na Ilha de Florianópolis, SC, constitui um problema de saúde pública, devido à possibilidade de transmissão de zoonoses. Estes resultados reforçam a importância da implantação de programas sanitários de controle de parasitas e programas de educação, esclarecendo os riscos de transmissão destas zoonoses à população, a fim de reduzir os riscos de contaminação ambiental nas praias de balneários.(AU)

Parasitoses intestinais em crianças de creche comunitária em Florianópolis, SC, Brasil / Intestinal parasites in children at a community creche in Florianópolis, SC, Brazil

No presente estudo, foi observada a frequência de enteroparasitoses em crianças de 2 a 6 anos de idade, matriculadas na Creche Municipal Anjo da Guarda, na cidade de Florianópolis, Santa Catarina, Brasil. Foram analisadas 57 amostras fecais de agosto a novembro de 2012 pelos métodos de Lutz e de Faust et al. Obteve-se positividade para enteroparasitos em 61,4 por cento das crianças, sendo encontrados os seguintes agentes etiológicos: Blastocystis hominis (40,4 por cento), Giardia lamblia (24,6 por cento), Entamoeba coli (22,8 por cento), Endolimax nana (12,3 por cento), Entamoeba histolytica/E. dispar (7,1 por cento), Entamoeba hartmanni, Enterobius vermicularis e Iodamoeba bütschlii (1,8 por cento). Em relação ao grau de parasitismo, 24,6 por cento das crianças apresentavam monoparasitismo, 26,3 por cento biparasitismo e 10,5 por cento poliparasitismo. A faixa etária mais acometida foi a de 5 a 6 anos (72,2 por cento). Os resultados observados mostraram elevada prevalência de protozoários intestinais e reforçam a necessidade da implantação de medidas de prevenção e educação em saúde que visem melhorar as condições de vida das crianças e dos adultos.

In the present study the frequency of intestinal parasites was observed in a group of 2 to 6 year old children enrolled in Anjo da Guarda municipal daycare, in Florianópolis, Santa Catarina, Brazil. 57 fecal samples were processed from August to November of 2012, using the methods of Lutz and Faust et al.. 61.4 percent of the children tested positive for intestinal parasites. The etiological agents were: Blastocystis hominis (40.4 percent), Giardia lamblia (24.6 percent), Entamoeba coli (22.8 percent), Endolimax nana (12.3 percent), Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar (7.1 percent), Entamoeba hartmanni, Enterobius vermicularis and Iodamoeba bütschlii (1.8 percent). With respect to the degree of parasitism, 24.6 percent of children had monoparasitism, 26.3 percent had biparasitism and 10.5 percent had polyparasitism. Children aged 5 to 6 years presented more parasites (72.2 percent). The observed results showed a high prevalence of intestinal protozoa, and reinforce the importance of implementing preventative measures and health education to improve the lives of children and adults.

Cultivo da Entamoeba histolytica Schaudinn, 1903 a partir de amostras fecais / Cultivation of Entamoeba histolytica Schaudinn, 1903 from fecal samples

O presente trabalho teve como objetivo padronizar o isolamento e a manutenção de cepas de E. histolytica a partir de fezes humanas, para posteriores estudos. No período de agosto de 1989 a junho de 1990 foram estudadas 105 amostras fecais contendo cistos viáveis de E. histolytica. O isolamento e a manutenção das cepas foram realizados segundo a técnica descrita por Silva, com algumas modificações. Após a sedimentação espontânea das fezes pelo métod de Lutz, uma parte do sedimento foi semeada diretamente em meio de Pavlova modificado e outra, após tratamento prévio com HCl 0,5 N. As culturas foram mantidas com sucesso. Os autores discutem a metodologia empregada e concluem que as modificações introduzidas foram satisfatórias. Constataram também que Escherichia coli e Klebsiella sp presentes nos subcultivos favorecem o desenvolvimento do protozoário.